MAOI-preparat bör inte tas med alkohol och inte heller med host-, förkylnings-, influensa- eller hösnuvemedicin. De kan även påverkas av andra mediciner, som till exempel tricykliska anti-depressiva medel.

Man måste vara försiktig när man tar fler än en medicin. Matvaror som innehåller tyramin bör undvikas när man tar MAOI-preparat. Det kan till exempel vara: bondbönsskidor, ost, Chianti-vin, vilt, hembrygd öl, paté, inlagd sill och jästextrakt.
MAOI-preparat kan orsaka död om de kombineras med viss mat, tas med vissa andra mediciner eller tas i överdos.

Patienter som slutar med MAOI-preparat bör inte börja med något annat anti-depressivt medel på två veckor. Om man ska börja med MAOI-preparat, måste man vänta minst fem veckor efter man slutat med fluoxetin; två veckor efter man slutat med något annat MAOI-preparat, paroxetin eller sertralin; och en vecka efter man slutat med andra anti-depressiva medel (tricykliska, SSRI-preparat eller liknande).
Personer som tar MAOI-preparat borde bära med sig ett varningskort.